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1biopython / biopythonBiopython 的官方 git 存储库(最初从 CVS 转换而来)PythonNOASSERTION · 限制商用 / 未知名次历史不足5,2551,990——2026-11-02
2jwohlwend / boltzBoltz 生物分子相互作用模型的官方存储库PythonMIT · 宽松,可直接商用名次历史不足4,289911——2026-05-29
3aqlaboratory / openfold可训练、内存高效且适合 GPU 的 PyTorch 实现方式,用于复现 AlphaFold 2PythonApache-2.0 · 宽松,可直接商用名次历史不足3,449699——2025-12-16
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